Geología Numérica: Ciencia de Datos para Geociencias
2020-08-19
Prefacio
Este libro es producido en Markdown (Xie et al., 2018), usando bookdown (Xie, 2016).
El paquete bookdown puede ser instalado desde CRAN o GitHub:
install.packages("bookdown")
# version en desarrollo
# devtools::install_github("rstudio/bookdown")
Este libro se basa en el material creado para el curso G-4101 Geología Numérica, de la Escuela Centroamericana de Geologia, Universidad de Costa Rica, pero la idea es ir expandiendo los temas más allá del curso, y que sirva como base para ir promoviendo la cuantificación de la geología. El libro hace uso del software estadístico y de programación R (R Core Team, 2019) para desarrollar la parte práctica de los temas cubiertos en la teoría.
Existe un repositorio en GitHub para este proyecto (geolonum), donde se pueden acceder a los documentos y datos usados en este libro. Adicionalmente, se ha creado un paquete que ofrece funciones adicionales que serán usadas en algunos de los temas que se van a tratar. Para instalar y ver la documentación del paquete se puede ir a GMisc y seguir las instrucciones de la instalación (el paquete no esta en CRAN, esta en GitHub, por lo que no se puede instalar de la forma convencional).
El libro se divide en 2 partes principales:
- Uso de R (Capítulos 1 al 6)
- Análisis de datos (Capítulos 7-19)
En la parte de análisis de datos se cubre lo básico de álgebra lineal, para luego caer en la parte gruesa del curso que es estadística. En esta parte se ve lo que es estadística descriptiva (univariable y bivariable), principios de probabilidad, distribuciones de probabilidad, estadística inferencial (pruebas de hipótesis, estimación), y estadística no paramétrica. La parte final del curso cubre temas relacionados con geociencias (datos direccionales, secuencias, y geoestadística), donde se aplican conceptos anteriormente adquiridos en la sección de estadística.
Se consideran las siguientes como las principales contribuciones y novedades de este documento (en ningun orden respectivo):
- En idioma español. La mayoría de recursos que presentan los temas abordados están en inglés, lo que dificulta el acceso a la información para quienes no manejan este idioma.
- Temas y ejemplos con datos típicos de geociencias. No existen muchos textos, comparados con la cantidad que existen para otras ciencias, que traten temas específicos de geociencias, y mucho menos en español (punto anterior), por lo que se hace un enlace entre la teoría y la aplicación a temas pertinentes a esta área de las ciencias, esperando que el aporte resulte en una mayor cuantificación de esta ciencia que ha sido muy cualitativa.
- Introducción a tamaños de efecto. En los capítulos de pruebas estadísticas (paramétricas y no-paramétricas) se introduce el concepto de tamaño de efecto, así como su interpretación, y su uso en el reporte de resultados de pruebas estadísticas. Esto último es una práctica que se sugiere y recomienda para que los resultados obtenidos sean más robustos, comparables, y reproducibles. En los recursos en español y de geociencias en inglés este tema no se presenta del todo, por lo que se considera un aporte significativo hacia una mejor práctica de análisis y reporte de resultados cuantitativos en geociencias.
- Uso de software libre. No solo se presenta la teoría y cómo realizar los cálculos de forma manual, sino que además se introduce el software libre R (de manera exhaustiva en los primeros 6 capítulos) y se muestra cómo aplicar las diferentes técnicas y métodos descritos en el texto por medio de esta herramienta.
- Libro “vivo”, lo cual permite agregar y/o actualizar los contenidos de manera más eficiente y dinámica.
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Referencias
R Core Team. (2019). R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing. https://www.R-project.org/
Xie, Y. (2016). bookdown: Authoring Books and Technical Documents with R Markdown. Chapman; Hall/CRC. https://github.com/rstudio/bookdown
Xie, Y., Allaire, J., & Grolemund, G. (2018). R Markdown: The Definitive Guide. Chapman; Hall/CRC. https://bookdown.org/yihui/rmarkdown